奥密克戎新分支 BA.5 或重拾肺部感染，具有很强免疫逃逸能力，这一特点意味着什么？我们该如何应对？

据科技日报消息，除了传播速度更快、病毒载量更高，业内专家表示，相较于奥密克戎以往变异株，奥密克戎变异株新分支BA.5出现了入侵肺部、具有很强免疫逃逸能力的新情况。一位免疫学者表示：感染过新冠病毒的人仍会再一次感染BA.5，此外，BA.5对肺功能的影响增大，死亡率也会增加，必须密切关注。
美国加州大学圣地亚哥分校医学中心副教授李克峰解释，之前的原始株能够利用肺泡细胞有而上呼吸道没有的蛋白入侵人类的肺，增加重症风险，奥密克戎BA.1失去了这个能力，大多感染上呼吸道，而BA.5又找回了这个能力，“重拾”肺部感染。

tmd我前几天刚得流感，基本，1周只能躺着，啥鸡儿工作都干不了，第二周情绪和状态很差，除了不用脑子的活，稍微需要精神状态的复杂工作，也是干不了。1年的4%就没了。如果卷的厉害的工作，多得几次流感，工作铁定丢。如果是学生，同样水平的你1年躺下2次，别人不躺，淘汰的肯定是你。

如果所有人每年两轮新冠，就算是大号感冒，起码15%的经济就毁了。按欧美国家的增长率，那就是倒退10年起步。。。。

怪不得所有工业国基本都逆差，特么的大量的劳动口一会得病，一会照顾家里的病人，还能干个鸡儿。美国天然气设施一直爆，也可能不是什么阴谋，就是太多人得了mild的新冠，精神状态不好，就容易出事故。

怪不得欧美一直鼓动买办和汉奸鼓吹躺平，tmd他们劳动力每年10%的时间头疼脑热，10%时间照顾生病的家人，那和中国还竞争个鸡儿。反正我在的软件和ai行业，我lock down在家里不影响多少效率，得个感冒啥也干不好，写的是bug不是代码，得个新冠。。。我可不敢以身试命。。。。

专业的东西 @拍照稀烂帮帮主 人家说的很好了。
我就只说现象。
1.欧洲早就躺平了，并且在4-6月先后宣布解除口罩强制令，于是大家欢呼的摘下了口罩。
瑞士从五月起，只有几个老外同学坚持n95上课，中国同学反倒带的不多，因为有peer pressure，同胞们像我脸皮这么厚的还是少，所以很多人被迫摘下了口罩。
但是从六月末七月初起，我去法国买菜，已经开始看见路上（居然还是户外）和超市都有老外自觉带口罩了，有老有少，地点Mulhouse。
那会瑞士还是头铁很多。
仅仅两周过去，今早我来学校路上，火车上碰见四五个带口罩的，下火车的时候看见了更多。
没有强制令，大家普遍头铁，有peer pressure，大家为什么把口罩戴上了呢？
原因简单的很，要么自己吃了大苦头，要么身边有惨案。
2.最近救护车声音明显变多了，不是几天一回的那种多，是一天好几回的那种多，
下面这条微博是我周六晚发的



吐槽：阅读理解阅读理解！我放这个截图是为了证明我看到的救护车救护车！图片是猴痘的好么我微博吐槽的是捂嘴

发完就听见了第六波救护车，绝了。
小红书也有姐妹发现有同样的现象。
叫救护车多贵啊！！！
没啥毛病谁叫救护车啊！！！
现在这边新来的这波据说就是ba.5
超级不乐观，
我现在最讨厌看到的就是邮件里出现 on site俩字。
请让我们这些怕死的弱鸡好好在家苟着不好吗。
问题里问应对，
戴口罩，勤洗手。我们靠这个苟过来疫情前三年，希望把后面的也一起苟过去。
另外吐槽，不知道是不是疫情造成的经济大幅度下滑，最近报复社会的事情越来越多了。上个月刚有宝妈群里求助，幼崽儿被放在公交座椅缝里的注射器给扎了，今天就有其他同胞在SBB上遇见了这个，绝了。


大家多保重，希望大家都能健健康康的挺过这波变异
<hr/>服了，每次说句实话都有那种头像都没有的三无小号在那yygq：你觉得国内好你回来啊。
是不是因为一篇大实话你只能找到这么一个刺啊，
真不好意思，我们毕业是一定要回去的。
我们是实现了来去自由的人，回去是我们的选择；
看着你们想润润不掉的样子，实在是同情遗憾。
其实吧，思路打开点，虽然没钱没技术没能力欧洲暂时不要，但是你们可以去缅甸去泰国曲线救国啊。你们的精神故乡为了从东南亚引进一些什么职业，还是给了不少优惠的。饭要一口一口吃，润要一步一步来。
房子一定要卖掉，穷家富路，破釜沉舟，有钱有决心，梦想一定会实现的，赶紧行动起来！

谢各位老铁邀。
首先，咱一直以来都有@还是不注名好 老师一毛一样的困惑~
——请品鉴：


具体来说，他提到的那篇50+%肺部病变的出处见这里[1]：




以上是针对2022年1月8日到2月7日期间，国内首次Omicron社区爆发事件一共430名确诊病例的回顾性研究。
（各位别嫌弃研究规模小，天津人民已经尽力了，前后全市核酸普筛搞了四轮，统共只揪出来这么不到500例……这就远远赶不上后来的华山派。人家华山派挑挑拣拣排除掉各种高危组，最后还能轻松拿出手几万例，研究规模超英赶美毫无悬念，失敬失敬）
总之，把上表红框部分翻译成人话：

• 所有受试者当中，普通型（moderate）占比50.2%；
  
• 其中成年人普通型占比63.9%；
  
• 再其中，没打疫苗的话，普通型占比83.3%。
  

那么所谓的“普通型”是啥意思呢？
——请再品鉴：



《诊疗方案》第九版第9页

所以翻译成人话：

• 普通型=轻型+影像学可见的肺炎表现。
  
• 也就是说，天津这接种率九成左右的430位病例里面，超过一半有影像学可见的肺炎表现；
  
• 而如果没打疫苗的话呢，就是超过八成有影像学可见的肺炎表现。
  

——顺便还有天津疾控张主任接受央视采访的原话作为旁证：

天津疾控张主任接受央视采访
https://www.zhihu.com/video/1529776792424034304
（张主任接受采访时暂时只有360多例确诊，上面谢院士他们这项研究则包含了全部430例确诊，所以两边提到的肺炎表现比例略有差异）
所以情况就是这么一种情况：
既然从来就没丢掉，又哪儿来的“重拾”？


当然啦，当初天津这个数据，看着实在辣眼睛，
以后应该不会再出现了……
现在的时代潮流是“不检测就没有”，
肺炎表现也同理，
只要不做CT，就没有肺炎表现，皆大欢喜。
<hr/>顺便跑个题，展开一点。
当初红极一时的“Omicron缺乏肺嗜性”的说法，
其实并不是一条单独冒头的谣言，
而是一整套谣言体系。


——具体请品鉴：


这套谣言体系，总结总结就是：

• R0高到突破天际（言下之意就是靠着NPI挡不住啦，快躺平吧）；
  
• 无症状感染比例高（言下之意就是MILD，并且还防不胜防，快躺平吧）；
  
• 缺乏肺嗜性（言下之意又是MILD，快躺平吧）；
  
• 病死率已经低于流感（言下之意还是MILD，快躺平吧）；
  
• 原始株和Omicron疾病表型完全不一样（言下之意就是各位该与时俱进啦，快躺平吧）……
  

怎么样？
以上五条谣言相互印证，相互补充，相互强化，自成体系，
想逐条反驳的话呢，还得花费五倍的功夫，
这谣狗的功力，简直突破了天际哎~
总之，关于以上五条谣言当中的四条，可以看这里：
[挖坟鞭尸] “Omicron和原始株引起的是两种不同疾病”…到底是什么鬼？？最后还剩“R0高到突破天际”这条，
这条实在太假，
咱之前一直觉得根本没必要理会的……
但没想到随着BA.5一桶浆糊，
这一条又被刨出来热炒了~
没办法，晚点挤点时间来喷一喷吧，哎~
<hr/>最后，顺便一提，
初步的体外试验数据显示，
BA.5使用TMPRSS2的酶切效率真的比BA.2更高。
——请品鉴[2]：


——元芳！拿放大镜来：


以上是AY.39.1（左）、BA.2（中）和BA.5（右）活病毒在ACE2-TMPRSS2 Hek293T细胞系的72小时CPE现场~
——元芳！上小视频：

BA.5 72H CPE
https://www.zhihu.com/video/1529825481033113601

——以及，剧透一个：


以上是仓鼠模型活病毒攻毒试验结果（抢跑版，暂时没链接）~
其中BA.4和BA.5暂时只有DPI四天的数据，
不过明显看得出来，BA.5攻毒组的体重降幅要大于BA.1、BA.2、BA.4和mock组~
所以BA.5在仓鼠模型的致病性应该也比其他Omicron高一点（这个跟之前佐藤老师那个假病毒模型的结果基本吻合）

但是呢，
从魔改版细胞系里面的TMPRSS2利用效率和CPE效应，
到动物模型攻毒实验结果，
最后到临床的肺炎表现甚至到组织嗜性，
中间每一步都还需要更多的实锤。
体外实验和动物模型的蛛丝马迹没法外推到人体，
关于BA.5肺炎表现的情况，还得再等几个月，
等到类似于上面谢老师他们那种研究结果出来了，才能最后实锤。

肺炎的表现还需要等等，脑膜炎的表现是看到了。
高传播能力，与免疫逃逸能力已是众所周知。
论噬肺，奥密克戎系列就没有不噬肺的时候。
我记得，Ba.2刚来的时候，讨论的就是Ba.2比Ba.1更噬肺。


所以，不是重拾，是Ba.5又更噬肺了……
但我不打算讨论这个，想写一下Ba.5的另一个症状。
Ba.5目前为止，一直不断重复说高传染性，与免疫逃逸，会引起更严重的疾病，我只在论文里看科学家写过。
但舆论上，好像都在忽略有可能会出现的严重症状……
只讲传染，症状还是在mild化，甚至见过国内报道说ba.5致病弱。
目前ba.5确实在进行中，没有足够的病例报告。
但…经手Ba.5患者的医生手中有病例。


医生反馈说，
许多患者有类似脑膜炎的症状:颈部僵硬、头痛、呕吐。

这几个症状不是单一出现的，是一组一起出现的。
也不是一两个患者，而是Many patients。


英国的病例，同样，一些患者出现BA.5脑膜炎样的症状，比如脖子非常僵硬，怕光线困扰。


英国医生也经历了Ba.5脑膜炎症状……
Dr Claire Taylor七月三日，她与她9岁的儿子被检测出阳性。
她儿子报告的一个症状是脖子僵硬。体温38.8℃，但没有任何感冒的症状。
她也一样。
她说：“我实际上根本无法移动我的脖子。
在第 10 天左右，左臂出现麻木和刺痛感。但仍旧无法移动脖子。


她认为，是病毒性脑膜炎。
脖子僵硬、头痛、呕吐、怕光……确实是脑膜炎的一组症状。


脑膜炎症状在过去的毒株中就有，但属实不算多见。
这次台湾Ba.2弄出了不少儿童脑膜炎脑炎的……
以为事不关己。



这下好了，Ba.5来了。
大人，小孩，都得脑膜炎去。
笑死。

参考：
https://www.newshub.co.nz/home/world/2022/07/covid-19-uk-gp-reveals-viral-meningitis-symptoms-linked-to-omicron-ba-5-infection.html

意味着病毒进化的主要选择压是抗体，NPI措施更重要

一、病毒的遗传和变异

新冠病毒是正链RNA病毒，RNA病毒的自然突变概率高，达到0.0001～0.000001之间。
突变可以体现为单个或多个碱基的替换、增加或减少。大部分突变会使得病毒死亡，少量突变可以让病毒存活。存活部分中，少量突变会影响病毒性状，如传播性、致病性、应对抗体的能力等。
突变的详细内容，可参照：
新冠突变机制及突变影响简介42 赞同 · 14 评论文章42 赞同 · 14 评论文章二、随着病毒种群的增大，病毒突变的几率在快速增加

病毒的种群越大（感染人数越多）、单次感染持续的时间越长（警惕免疫缺陷患者长期感染），病毒突变的概率就越大。
1.种群很大会增大变异概率。

假设病毒在某个患者体内出现可存活变异的几率为，则对于一个数量为n的宿主群体，病毒发生可存活变异的概率为 。即使为很低，只要n足够大， 就趋近于1。
单个感染者峰值病毒载量在10亿到1000亿病毒颗粒之间[1]，设平均值为100亿。


而全球日新增感染者约885万人[2]，假设人均感染10天，则总感染人数约为8850万人，病毒颗粒数量约为88.5亿亿，每天突变的病毒个体达到万亿级别。

2.长期感染有利于突变

有研究指出，每个人感染后在第六天病毒载量达到峰值，然后逐渐下降。[3]
免疫缺陷患者很难清除体内的新冠病毒，病毒可以在体内长期繁殖并不断变异。[4]
一些科学家认为，Omicron的突变是在免疫缺陷患者体内演化而来的，是此人长期感染的结果。

3.同时感染多种毒株会增大基因重组概率

当二种有亲缘关系的不同病毒感染同一宿主细胞时，它们的遗传物质发生交换，结果产生不同于亲代的可遗传的子代，称为基因重组（Genetic recombination）。


在大流行背景下，病毒经过2年多的进化，有越来越丰富的基因库。[5]


由于国际交通非常发达，不同地区的主流毒株都有前往其他地区的机会，人群交叉感染多种毒株的现象严重，不同病毒重组产生新毒株的概率很大。
例如毒株XE是奥密克戎亚型变异毒株BA.1和BA.2的重组毒株。
美国Helix实验室于2022年3月12日在预印本medRxiv上公布题为 Evidence for SARS-CoV-2 Delta and Omicron co-infections and recombination的论文。文中指出在美国29719个阳性病例样本中检测出2例完全由Delta-Omicron重组病毒感染的病例。[6]

4.病毒基因组越来越丰富，出现具备对抗既有抗体能力毒株的概率不断提高

每天突变的病毒个体达到万亿级别，即使只有0.01%的突变毒株存活，存活毒株只有0.01%具备更适应环境的性状，病毒每天也可以获得数以万计的有效突变。
同时，大多数国家并没有对感染者实施严格的隔离措施，相当多的有效突变有机会传播开来，在人群中经历“大浪淘沙”的竞争过程。

5.部分”特效药“起到了促进突变的作用

一部分特效药欺骗病毒RNA聚合酶，瘫痪病毒的基因组，让RNA病毒遗传信息出现大量错误[7]。

6.所以，随着越来越多的人感染新冠病毒，病毒的变异和重组已经进入正反馈状态，病毒通过重组丰富自身基因库的效率会越来越高


三、选择压的概念

选择压是进化生态学中的概念，指外界环境施加给物种演化方向的压力，不同的外在的压力导致物种向不同方向演化。[8] 假如：一个基因的选择压为0.001（比如拥有A基因个体的存活率比其他个体高0.1%），那么一个频率为0.00001的显性基因只要16100个世代就可增加到0.99的频率。


计算原文档：选择压推算.xlsx
在自然界，当选择压高的时候，在短时期中就可以形成新的品种。
例如在青霉素发明的时候，细菌普遍没有耐药性，在普遍使用抗生素的环境中，少数可以耐药的细菌被筛选出来，成为主流。
而自然感染后、接种疫苗均会产生抗体，这些抗体会阻碍既有病毒的继续传播，所以抗体成为主要选择压。
由于新冠具备潜伏期可传播，发病后病情恶化较慢（死亡高峰落后于感染高峰2-3周），致病性并不显著影响传播效率，所以致死率没有成为主要选择压。
例如早期的Omicron（B.1.1.529）的祖先是B.1，前者的致病性更强。

四、在人群普遍具备抗体的环境下，只有“可重复感染既往感染者”能力的毒株才能成为主流

以下为新冠流行循环的简要过程
1.在2019年年初，几乎所有的人都没有感染过新冠、更没有打过疫苗，普遍没有抗体，对病毒不设防，抗体不构成选择压
2.2020年年中，全球大多数国家经历了第一次普遍感染（原始毒株），叠加疫苗影响，相当多的人有了抗体，而这些抗体可以阻止既有毒株的继续传播

2021年年初，在印度第五轮针对新冠病毒的血清抗体检测中，新德里2.8万个样本中有60%被检出血清抗体阳性。据印度媒体报道，新德里约有2000万人，这意味着至少已有1000万人感染过病毒。这项数据被印媒视为抗击疫情的一大利好，认为新德里实现群体免疫指日可待，或正在走向群体免疫。[9]

3.如果一直没有出现可以无视之前抗体的病毒，既有病毒可感染的人数仅限于未感染者，而未感染者占人群比例会越来越低（每人密接人员数量不变，但可传染的比例逐渐降低），疫情传播效率越来越低。

印度卫生部2021年1月25日公布的最新疫情数据，过去24小时内，2500万居民的新德里地区新增确诊病例仅为185例。

4.但如果毒株A（例如Delta）具备免疫突破能力，就可以感染到既往感染者，传播速度就会显著加快，成为主流毒株。
在这个阶段，抗体成为病毒进化的主要选择压。
5.随着毒株A的广泛扩散，人群抗体比例增加，又回到状态3。只要出现状态4，就会开始新一轮循环。
由于感染人数极多，出现状态4几乎是必然的。
6.状态3-5不断循环，具备“免疫突破”能力的毒株引发一轮又一轮疫情。
可参考南非的几波疫情[10]



五、趋势总结

1.病毒种群越来越大，再加上一部分促进突变”特效药“的应用，病毒基因组越来越丰富。
2.在抗体选择压下，新毒株必然具有”免疫突破“能力，可以应对感染、疫苗产生的抗体，所以到一定阶段就需要重新开发药物和疫苗。
3.现在每隔3个月左右毒株就要更替一次，但疫苗、药物的开发周期很难继续缩短，所以疫苗和药物策略遇到的挑战会越来越大。
4.由于新冠具备潜伏期可传播，病情恶化慢的特性，致病性不构成主要选择压，所以下代毒株的致病性是随机的。
5.NPI措施（非药物公共卫生干预），例如勤洗手、戴口罩、保持社交距离、核酸筛查、流调、隔离都不会受到病毒突变显著影响。