下辖作战部队包括驱逐舰第3、6支队，海军上海基地（护卫舰13、14支队、扫雷舰第4、9大队、导弹艇30大队，登陆艇3大队等）、福建基地（护卫舰第15、16支队，导弹艇31大队等），潜艇第22、24支队，登陆舰第5支队，作战支援舰第2支队，海航，海军陆战队。
直属支队
直属部分
驱逐舰第3支队
（舟山定海师级；）
052D驱逐舰4艘：134绍兴（DL/22）、133包头（DL/21）、132苏州（DL/21）、131太原（2018）。
956EM型驱逐舰2艘：139宁波（2006）、138泰州（2006）。
956E型驱逐舰2艘：137福州（2001）、136杭州（2000）。
054A护卫舰2艘：533南通（18/原601）、531湘潭（2016）。
驱逐舰第6支队
（舟山定海，师级）
052D型4艘：157丽水（DL/22）、156淄博（DL/20），155南京（18）、154厦门（17）
052C型4艘：153西安（2015）、152济南（14）、151郑州（13）、150长春（13）
054A型2艘：599安阳/18、515滨州/16
潜艇第22支队（10）
（宁波大榭岛, 师级单位）
039A型4艘：330（06）、331（07）、332（09）、333（10）。
039B型6艘：334（11）、335（11）、336（11）、337（12）、338（12）、339（12）。
潜艇第42支队（8）
（宁波象山，师级单位）
基洛877EKM型2艘：364、365。
基洛636型潜艇2艘：366、367。
基洛级636M型4艘：368、369、370、371。
登陆舰第5支队
（上海基地虬江码头，师级单位；下辖第13、14、15登陆舰大队。）
直属舰艇
075两栖攻击舰1艘：32广西（2022年初）、34浙江（预计2023年中）。
071型综合登陆舰3艘：986四明山（2020）、980龙虎山（2018）、988沂蒙山（2016）。
登陆艇13大队（装备726A型气垫登陆艇7艘，958气垫登陆艇2艘。）
第14大队(上海虬江，代号91602，团级单位)
072A/B型登陆舰7艘：974武夷山（2016）、975徂徕山（2016）、977五台山（2016）、976天目山（2016）、979太行山（2015）、978大别山（2015）、973八仙山（2003）。
第15大队(上海虬江，代号91718，团级单位）
072II型登陆舰3艘：931洞庭山（1994）、932贺兰山（1994）、933六盘山（1993）。
072III型登陆舰5艘：972天台山（2002）、970黄岗山（2001）、971普陀山（2000）、969九华山（2000）、968雁荡山（1997）。
上海勤务船中队
作战支援舰第2支队
(舟山定海，师级单位；下辖防救船大队、侦测船大队和舟山勤务船大队等。)
直属舰艇
903A综合补给舰2艘：966高邮湖（2016）、890巢湖（2013）。
903型综合补给舰1艘：886千岛湖（2005）。
718型综合补给船1艘：882鄱阳湖（1979）。
防救船大队
直属舰艇
925打捞救生舰1艘：820东钱湖（原862崇明岛，1977）。
922IIIA型打捞救生船1艘：821太平湖（原东救332）。
920医院船1艘：866和平方舟（原岱山岛）。
中型修理浮船坞1艘：东修912。
医疗救捞中队
快速医疗救助艇2艘：东医12、13。
946型近海潜水救生船2艘：东救304。
917型三体救生船1艘：东救335
拖船中队
侦测船大队
(宁波镇海，代号92899，团级单位；下辖航测中队、航道中队、航标中队）
直属舰艇
815A电子侦察船2艘：798玉衡星（原858舰，2018）、795天枢星（原855，2015）。
815型电子侦察船1艘：851北极星（1999）。
636A型海洋综合调查船3艘：海洋二十八号/879朱光亚（17），海洋二十四号/874邓稼先（2016）、872竺可桢/海洋二十号（2007）。
航测中队（3）
航道中队（8）
航标中队（5）
侦察船中队
上海基地
（上海吴淞，师级单位，原猎护舰1支队和上海保障基地、舟山水警区、温州水警区等合并组建而成；下辖护卫舰13、14支队、扫雷舰第4、9大队、导弹艇30大队，登陆艇第3大队，上海、舟山岸勤部，独立观通3、17团、高炮岸导混编13团、防空4团，防化营等。）
两个护卫舰支队
护卫舰第13支队 （8）
驻连云港连岛，由原快艇16支队猎潜艇72、79大队组成，装备056A轻护1艘，054A1型2艘、054A型4艘；054A2型1艘。
056A型护卫舰1艘：608聊城（2020）。
054A型护卫舰4艘：529舟山（11/21）、530徐州（11/21），549常州（2011）、548益阳（2010）。
054A1型护卫舰3艘：578扬州（2015）、577黄冈（2015）、513淮安（预计23年）。
护卫舰第14支队（9）
驻上海吴淞，由原护卫舰8大队和护卫艇16大队组成，装备056A型7艘、053H3型2艘；将装备054A2型2艘。
056A护卫舰7艘：639株洲（2014/原594）、638三门峡（2014/原593）、610朔州（19）、611六安（20）、616泰安（20）、637十堰（21）、636济宁（21）。
053H3型护卫舰2艘：521嘉兴（1999）、524三明（1999）。
054A型2艘：516九江（预计23年）、517淮北
扫雷舰第4大队
（上海吴淞，团级单位）
081型扫雷舰2艘、081A型扫雷舰3艘
扫雷舰第9大队
（舟山岱山长涂，团级单位）
082I型扫雷艇4艘、082II猎扫舰2艘、无人扫雷工作艇6艘
导弹艇30大队
(宁波石浦，团级单位；装备022型导弹艇12艘）
登陆舰3大队（11）
(宁波石浦，团级单位，辖3个小型登陆舰中队）
观通3团
第17观通团
高炮岸导混编13团
防空4团
上海岸勤部
（上海吴淞；副师级单位；下辖若干岸勤分队、消磁站、上海勤务船大队等。）
舟山岸勤部
福建基地
（由福建保障基地、快艇21支队合并编成，下辖护15、16支，导弹艇31大，岸导1团，观通1旅、岸勤部等。）
两个护卫舰支队
护卫舰第15支队
驻福建宁德三都澳
056A护卫舰7艘：642德阳（2018/原554）、641义乌（2017/原518）、640鄂州（2017/原513）、643宜春（2017/原556）、615孝感（20），609石嘴山（21）、619南阳（21）
054型护卫舰2艘：526温州（2005）、525马鞍山（2005）。
053H3型护卫舰2艘：567襄阳（2002）、566怀化（2002）。
054A2型2艘：537宜兴（1/23），535宝鸡（1/23）
护卫舰第16支队（7）
驻厦门和平码头
056A护卫舰4艘：644铜仁（2016/原507）、645宣城（17/原535）、617景德镇（20）、618商丘（21）。
054A1护卫舰3艘：532荆州（2/16）522资阳（22年）、523红河（22年末）
导弹艇31大队
(福鼎沙埕，团级单位；装备022导弹艇12艘）
岸导1团
观通1旅
福州岸勤部
(宁德，副师级单位；下辖若干岸勤分队、消磁站、福州勤务船大队等。)
其他单位
工程指挥部
（宁波江东，师级单位；下辖工程大队、工程技术大队、潜水工程大队和工程船大队。）
东部战区海军舰艇训练中心
（上海吴淞，师级单位,装备靶船6艘，挂网靶船10艘。）
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