为什么有中国上古神话诸神体系和天庭体系两种版本，其各自来源是什么？两者是否冲突或融合？

为什么有中国上古神话诸神体系和天庭体系两种版本，其各自来源是什么？两者是否冲突或融合？

不止两套，要说起来可能最多有108套。
貌似看过一本写［神道］的书，说是［三十六洞天七十二福地］这种［小世界］，就是所谓的［混元圣人］和［大罗神仙］们开辟的小世界，里面都有一套［天庭］。
也就是说，我们这个世界，有108个平行的小世界，附着在我们这个世界的内部。有108个类似于［玉帝］［太一］［盘古］［耶和华］［梵天］［宙斯］［奥丁］这种［界主］。
而我们中国地区，好像有两三个小世界的［出口］，所以，这些小世界里面的信息被我们所获取，才出现了我们现在的神话。

上古神话其实是有点带有夸张性质的历史属性的，但是没有任何能看到的史料加以佐证。比如天地人三皇，伏羲神农燧人等五氏，比如黄帝玄帝喾帝等五帝，比如跟黄帝打架的蚩尤，帮着黄帝的旱魃等。既不能证实其存在也不能证实其不存在，那就归类到神话吧。
后来的张友仁，姜子牙主要出处可能是封神榜，逐渐的把历史上的名人都位列天班，给个称呼，代表了人民群众一种美好的愿望吧，比如关二爷，既管下雨收成，又管招财进宝，还管黑社会收小弟，还是伽蓝护法，一专多能，全栈式神仙。

我猜你说的是巫妖大战和玉皇大帝。
这都不是上古神话，前者是网络小说的杜撰，最早出自佛本是道；后者是道教在近古编的仙话，和神话有明显区别。

中国文化，按照李泽厚先生的说法"由巫而史"。分为"大传统"和"小传统"。
大传统就是礼乐制度，天文学，历史学之类，其实都是起源于巫术。
有些现代人难以理解为什么古代把"乐"，也就是音乐看得那么重，甚至和"礼"放到平级的位置，因为现代音乐主要是娱乐。但是考虑到其巫术起源，那么很容易理解:跳大神的姿势和伴奏当然都很重要。
小传统就是民间的占卜，跳大神之类。其实本来也是大传统，占卜曾经是非常重要的一件事情，《周易》的地位也极高。然而最后流落民间，变成了算命先生。。。
所谓"上古神话"，基本产生在"巫"的时代。
而题主所说的"天庭体系"，产生于"史"的时代。天官们为了证明"天子"的合法性，所以天庭体系是人间朝廷的复刻版。中国的星图中不仅有天上的君王百官，车马也备好了，甚至连厕所都有，甚至连"屎星"都有。真是事无巨细，完全复刻。。。所以，也有那么一点无聊。
当然，天文上这么努力，历史上当然也不能落后。（值得一提的是，相当长的时间里，天文历法和修著历史都是太史令的职责）上古神话的体系化就开始了。于是系统化的三皇五帝神话出现了，看起来非常"合理"的中国上古历史出现了。期间修改了多少次就不好说了，总之三皇五帝就有好几个版本，黄帝，炎帝，蚩尤的关系也有好几个版本。
简单来说，上古神话巫术时代已经有了，进入历史时代以后，将其作了系统化和历史化处理。当然，也有些不重要或者难处理的内容放着没动。也有些是"小传统"的文化人处理的。
天庭体系是太史们努力造出来的，其部分内涵由小传统的文化人丰富。
大传统的文化人编辑这些的目的是一样的，就是证明天子统治天下有理，是天命。
上古巫师和小传统文化人的目的性就不这么明确了。
当然，有些上古神话可能是外来的。例如盘古，外来可能性甚大。盘古神话见于书籍，不早于汉朝。尸体化为万物之说，与印度，北欧神话颇相近。与中国其他神话风格不搭。况且盘古身上的"诸虫"化为人类的说法，与女娲造人神话有冲突。当然，女娲造人也是东汉才见记载，不比盘古早。然而，女娲本身的出现比盘古早得多。
另外，盘古撑混沌，开天辟地。但是早在《庄子》中就有混沌以为被凿七窍而死之说。说明似乎庄子认识的混沌与盘古毫无关系。
况且，古书中提到的纪念盘古的地点，多在南方。作者，也多为南方人。华夏族起源于黄河流域，因此这个现象很奇怪。
因此，盘古神话系外来的可能性很大。
至于天庭体系里面的外来因素，本来倒是不多，但是后来被小传统文化人塞进去太多了，几乎都塞满了。

现在所谓的上古神话。

一般是指的先秦神话。也就是秦朝以前，商周时期流传的神话。


现在所谓的天庭体系。
一般指的是来源于民俗神话里的设定体系。多见于宋朝到明清时期的逐步完善。


不同体系会有冲突。


有融合吗？有。
说一个比较有意思的体系。
月亮神话体系。
为什么很多人弄不清楚我国的月神是谁？因为体系太多了。

如果到了道教这个体系，道教肯定要以自己的道教神太阴星君为月亮的老大。其他神是当不了道教月亮的老大的。

就像先秦神话有太阳神羲和。
但道教体系，绝不会让羲和当道教太阳的老大。

说完这个，来看看道教全真华山派的月亮神系。
这是一个融合多种体系的设定。


太阴圣班： 月府结磷星君妙果素月天尊垣下。素曜天宫。
月府太阴，结磷皇君，宝光幽照如来，妙果素月天尊。
天宫圣月，苏摩太阴皇君。
天宫圣月，灵辉太阴皇君。
天宫圣月，坤灵太阴皇君。
天宫圣月，金曜太阴皇君。
天宫圣月，金波太阴皇君。
天宫圣月，金枢太阴皇君。
天宫圣月，夜光太阴皇君。
天宫圣月，阴精太阴皇君。
天宫圣月，帝姊太阴皇君。
天宫圣月，姮娥太阴皇君。
天宫圣月，太素太阴皇君。
天宫圣月，太空太阴皇君。
天宫圣月，太明太阴皇君。
天宫圣御，望舒机星君。月宫神兔，得道星真。月宫神蟾，得道星真。
旸谷山涌月得道星真。细柳山馆月得道星真。虞洲浦驻月得道星真。
月宫众星，一切神祗，悉仗真香，普同供养。


在道教全真华山派的月亮神系里，
太阴星君是老大。
她的下属诸神里，有十三月皇君，分别代表十二月+闰月。
先秦神话的嫦娥（恒娥），就是十二月里的第十月。

除了十三月皇君。还有给月亮拉车子的月御望舒（她原本也是先秦神话的）。
有两只神兽，玉兔、蟾蜍。

除了太阴星君、十三月皇君、月御望舒，月亮中还有很多神仙。